Molkereien können privatwirtschaftlich oder genossenschaftlich organisiert sein. Die Molkerei Berchtesgadener Land ist genossenschaftlich organisiert, d.h. sie gehört keinen Aktionär:innen oder Privatpersonen, sondern den Landwirt:innen selbst. Die erwirtschafteten Gewinne werden in die Molkerei selbst investiert oder an die Landwirt:innen in Form von Milchgeld ausgezahlt. Private Entnahmen finden nicht statt.